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Nel Giappone del 1910, Iwamoto è uno studente di un'accademia militare segreta incaricata di indagare su fenomeni soprannaturali che lo Stato non può rendere pubblici. Durante una missione, incontra un giovane dotato di poteri anomali, emarginato e in pericolo a causa della sua natura. Riconoscendone il valore, Iwamoto gli consegna una lettera di raccomandazione, permettendogli di entrare nell'orbita dell'accademia. Il ragazzo viene così coinvolto in una serie di incarichi che lo portano a confrontarsi con spiriti, misteri e minacce occulte diffuse in tutto il Paese.